商标纠纷的抗辩事由，一般分为两类，即诉讼程序理由抗辩和诉讼实体理由抗辩。

诉讼程序理由抗辩，一般为诉讼主体资格抗辩、诉讼管辖抗辩和诉讼时效抗辩。

诉讼实体理由抗辩一般为商标权无效抗辩和未侵权抗辩。

1、主体资格抗辩

诉讼主体资格抗辩，即商标纠纷诉讼的当事人一方，就其对方是否具备原告、被告、共同诉讼人及第三人的资格提出抗辩理由，从诉讼程序入手，争取诉讼中的主动权。

2、案件管辖抗辩

案件管辖抗辩，即商标纠纷的当事人一方，对案件受理的级别管辖、地域管辖提出抗辩理由。

3、时效抗辩

时效抗辩，即商标纠纷的当事人一方，就其案件是否超过诉讼时效，是否超过注册商标争议期限和商标异议期限，提出抗辩理由。

4、商标权无效抗辩

根据《商标法》第四十一条的规定，在法定的期限内，他人可以对违反法律规定的注册商标提出撤销申请。同样，在商标侵权诉讼中，被控侵权人有权对他人的商标权提出无效抗辩，不仅包括对注册取得商标权的商标注册无效提出抗辩，而且还可以对注册或未注册的商标是否有驰名商标权进行抗辩。抗辩成功，商标注册被撤销或驰名商标不成立，则侵权行为不成立。抗辩不成功，注册商标的商标权及驰名商标的权利将继续有效，商标侵权才有可能成立。